Không gian mở rộng hơn 6.700 km2 sau hợp nhất đặt TP HCM trước bài toán phát triển một siêu đô thị không chỉ lớn hơn về quy mô mà còn phải thích ứng với các thách thức dài hạn như sụt lún, nước biển dâng, ngập úng và áp lực đô thị hóa. Theo các chuyên gia, quy hoạch TP HCM trong 100 năm tới cần nhìn nhận lại mối quan hệ giữa không gian xây dựng và hệ sinh thái tự nhiên thay vì chỉ tập trung mở rộng đô thị.